1. Näpunäide: akvarellpliiatsi ots on üldiselt ümmargune, markerpliiatsi ots aga lame, mis jaguneb fiiber- ja vaht-tüüpi otsikuks.
2. Tint: markerid on veepõhised, õlipõhised ja alkoholipõhised, samas kui akvarellpliiatsid on ainult ühte tüüpi veepõhised.
3. Värvimine: akvarellpliiatsid ei saa värve virnastada, kuid markerid võivad värve virnastada. Markereid on lihtsam värvida kui akvarellpliiatseid.
4. Kasutamine: Akvarellpliiatsi eeliseks on see, et selles on piisavalt vett, värv on rikkalik ja särav ning puuduseks on see, et vesi on ebaühtlane, üleminek on ebaloomulik ja kahte värvi pole lihtne omavahel sobitada, nii et see sobib üldiselt laste maalidele ja seda saab kasutada ka markerina.
Markeri eeliseks on see, et vesi on ühtlane ja puuduseks on see, et värvikontrast on nõrgem, kuid need kaks on omavahel hästi kooskõlastatavad ning suudavad joonistada arhitektuurseid ja tööstusdisainilahendusi.
